Data Structure ?
220.02M
Data Structure ?
*The above analysis is the result extracted and analyzed by the system, and the specific actual data shall prevail.
README.md
ダウンロード元: http://quantum-machine.org/datasets/
概要
新しい医薬品や材料のコンピュータによるデノボ設計には、化学化合物空間の厳密かつ偏りのない探索が必要です。しかし、その規模が分子サイズと組み合わせ的に拡大するため、未踏の広大な領域が残っています。我々は、CHONFから構成される134,000個の安定した小さな有機分子について、計算された幾何学的、エネルギー的、電子的、および熱力学的特性を報告します。これらの分子は、1660億個の有機分子からなるGDB - 17化学宇宙のうち、重原子（CONF）が最大9個の全133,885種のサブセットに相当します。我々は、エネルギーが最小の幾何学構造、対応する調和振動数、双極子モーメント、分極率、並びに原子化エネルギー、エンタルピー、および自由エネルギーを報告します。すべての特性は、量子化学のB3LYP/6 - 31G(2df,p)レベルで計算されました。さらに、最も多い化学量論式C7H10O2については、134,000個の分子の中に6,095個の構造異性体が存在します。我々は、すべての構造異性体について、より正確なG4MP2理論レベルで原子化エネルギー、エンタルピー、および自由エネルギーを報告します。このように、このデータセットは、小さな有機分子の関連性のある、一貫性のある、包括的な化学空間に関する量子化学的特性を提供します。このデータベースは、既存の方法のベンチマーク評価、ハイブリッド量子力学/機械学習などの新しい方法の開発、および構造 - 特性関係の系統的な特定に役立つ可能性があります。
figshareを通じてダウンロード可能です。
引用方法 このデータセットを使用する際には、以下の2つの論文を引用するようにしてください。
L. Ruddigkeit, R. van Deursen, L. C. Blum, J.-L. Reymond, 化学宇宙データベースGDB - 17における1660億個の有機小分子の列挙, J. Chem. Inf. Model. 52, 2864–2875, 2012.
R. Ramakrishnan, P. O. Dral, M. Rupp, O. A. von Lilienfeld, 134,000個の分子の量子化学構造と特性, Scientific Data 1, 140022, 2014. [bibtex]
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