このデータセットには、最近、別の（ただし近縁の）分類群からの遺伝的混合を経験したヒヒの個体群における、12,000以上の雌雄ヒヒのペアの観察データが含まれています。このデータには、雌雄のヒヒの遺伝的および社会的情報、彼らが交尾したかどうか、および交尾が子孫の受胎につながったかどうかが含まれています。 ## 謝辞 このデータが収集された元の学術論文： Tung J, Charpentier MJE, Mukherjee S, Altmann J, Alberts SC (2012) Genetic effects on mating success and partner choice in a social mammal. The American Naturalist 180(1): 113 - 129. [http://dx.doi.org/10.1086/665993](http://dx.doi.org/10.1086/665993) このデータがダウンロードされたData Dryadのページ： Tung J, Charpentier MJE, [Mukherjee S](https://datadryad.org/discover?query=0000 - 0002 - 6715 - 3920&submit=Go), Altmann J, Alberts SC (2012) Data from: Genetic effects on mating success and partner choice in a social mammal. Dryad Digital Repository. [http://dx.doi.org/10.5061/dryad.4r9h61v8](http://dx.doi.org/10.5061/dryad.4r9h61v8) ## 概要 （元の論文より） 交尾行動は、個体の繁殖成功と種境界の維持という2つの現象に大きな影響を与え、これらは進化プロセスに寄与します。個体の繁殖成功との関連で交尾行動を研究することは多くの種で一般的ですが、遺伝的変異や種境界との関連で交尾行動を研究することは、社会的に複雑な種ではあまり行われていません。ここでは、近縁の分類群であるアヌビスヒヒ（Papio anubis）からの遺伝子流動を最近経験した野生のキバナヒヒ（Papio cynocephalus）の個体群に対する広範な観察を利用して、混合関連の遺伝的背景が交尾行動にどのように影響するかを調べました。我々は、交尾パターンに対する遺伝的背景の新たな影響を特定しました。これには、アヌビスヒヒに似た雄に生じる優位性や、キバナヒヒに似たペアおよびアヌビスヒヒに似たペア間の選択的交尾が含まれます。これらの遺伝的影響は、社会的支配順位、近親交配回避、および年齢とともに作用して、非常に非ランダムな交尾パターンを生み出しました。我々の結果は、この個体群が部分的に非ランダムな交尾によって引き起こされる、混合関連の進化的変化を起こしている可能性があることを示唆しています。しかし、遺伝的影響の強さは行動の可塑性と社会的相互作用によって調節されており、社会的に複雑な種における交尾行動に対する社会的文脈の強い影響を強調しています。 ## データ このデータセットには、以下の変数に関する12,000以上の観察データが含まれています。 - **female_id**：交尾候補ペアの雌ヒヒの3文字の「短縮名」ID。各雌ヒヒには一意のIDが割り当てられています。 - **male_id**：交尾候補ペアの雄ヒヒの3文字の「短縮名」ID。各雄ヒヒには一意のIDが割り当てられています。 - **cycle_id**：各雌ヒヒの発情周期の組み合わせに割り当てられた一意の番号。 - **consort**：雌と雄のペアが交尾した（1）か、しなかった（0）か（交尾する機会があった場合）。 - **conceptive**：発情周期が受胎につながった（1）か、つながらなかった（0）か。 - **female_hybridscore**：雌ヒヒのゲノムのうち、アヌビスヒヒの祖先由来の割合の推定値。推定手順の詳細については、「材料と方法」およびTungら（2008）を参照してください。 - **male_hybridscore**：雄ヒヒのゲノムのうち、アヌビスヒヒの祖先由来の割合の推定値。推定手順の詳細については、「材料と方法」およびTungら（2008）を参照してください。 - **female_gendiv**：雌ヒヒの遺伝的多様性の推定値。推定手順の詳細については、「材料と方法」を参照してください。 - **male_gendiv**：雄ヒヒの遺伝的多様性の推定値。推定手順の詳細については、「材料と方法」を参照してください。 - **gen_distance**：交尾候補ペアの雄と雌の間の遺伝的距離（Queller - Goodnight r）の推定値。 - **female_age**：交尾候補ペアの雌ヒヒの年齢。 - **male_rank**：交尾候補ペアの雄ヒヒの順位。 - **female_rank**：交尾候補ペアの雌ヒヒの順位。 - **males_present**：交尾候補ペアの群れに存在する成年雄ヒヒの数。 - **females_present**：交尾候補ペアの群れに存在する成年雌ヒヒの数。 - **male_rank_transform**：群れ内の雄ヒヒの数を考慮して、アクセス優先モデルへの適合度を反映するように変換された雄ヒヒの順位。詳細については、「材料と方法」および付録を参照してください。 - **gen_distance_transform**：交尾の確率が遺伝的距離および遺伝的類似性とともに減少するかどうかをテストするために変換された遺伝的距離の推定値。 - **rank_interact**：交尾候補ペアの雄ヒヒの順位と雌ヒヒの順位の乗法的相互作用。 - **assort_index**：交尾候補ペアの雄と雌のハイブリッドスコアから計算された選択的交尾指数。詳細については、「材料と方法」を参照してください。 - **female_age_transform**：最大限に繁殖力が高い（中年の）雌ヒヒの交尾行動の確率が高いかどうかをテストするために変換された雌ヒヒの年齢。 ## 着想 このデータセットで調べることができるいくつかのアイデアを紹介します。 - 遺伝的距離は交尾確率に影響を与えるか？ - 雌ヒヒの年齢は受胎確率に影響を与えるか？ - 雄ヒヒの社会的順位は交尾確率に影響を与えるか？