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細胞核分割医療画像データセット、異なる臓器の21,000個の細胞核を含む

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Medical Classification

このデータセットには、ラベル付けされたヘマトキシリン・エオシン（H&E）画像が含まれており、これは組織病理学で最も一般的に使用される画像タイプの1つです。これらの画像は、癌ゲノムアトラス（TCGA）から......

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*The above analysis is the result extracted and analyzed by the system, and the specific actual data shall prevail.

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このデータセットには、組織病理学で最も一般的に使用される画像タイプの 1 つである、ヘマトキシリン・エオシン (H&E) 染色画像が含まれています。これらの画像は、癌ゲノムアトラス (TCGA) から得られた 7 つの臓器に関する 30 枚のデジタル化された組織標本の全スライド画像 (WSI) から切り出されています。さらに、核の外観の変化を最大限に捉えるために、各患者からは 1 枚の WSI のみが使用されています。

これらの画像は 18 の異なる病院から収集されており、異なる研究室での染色方法の違いが、外観の差異のもう 1 つの要因となっています。各切り出し画像のサイズは 1000×1000 ピクセルで、組織の密集した領域から切り出されています。核の外観の多様性をさらに確保するために、このデータセットには、乳房、肝臓、腎臓、前立腺、膀胱、結腸、胃という 7 つの異なる臓器の良性および病変組織標本が含まれています。

この 30 枚の切り出し画像には、医学専門家によって標準化され検証された 21000 個を超える細胞核が含まれています。研究者は、このデータセットを、様々な細胞核タイプに適用可能な汎用的な細胞核セグメンテーション技術の開発とベンチマークテストに利用することができます。

デジタル顕微鏡組織画像における細胞核のセグメンテーションは、細胞核の形態測定や計算病理学における他の分析のために、高品質な特徴を抽出するのに役立ちます。細胞核の形態や外観の特徴（密度、細胞核と細胞質の比率、サイズや形状の特徴、多型性など）は、癌の程度を評価するだけでなく、治療効果を予測するのにも役立ちます。研究コミュニティは、このデータセットを、様々な細胞核タイプに適用可能な汎用的な核セグメンテーション技術の開発とベンチマークテストに利用することができます。

引用：

Kumar, N.、Verma, R.、Sharma, S.、Bhargava, S.、Vahadane, A. および Sethi, A.，2017 年。計算病理学のための汎用的な細胞核セグメンテーションデータセットと技術。IEEE 医療画像処理学会誌，36(7)，1550 - 1560 頁。

著者のプロジェクトウェブページ：

nucleisegmentationbenchmark.weebly.com