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LNDb CT肺結節患者スキャンデータセット(訓練)

LNDb CT肺結節患者スキャンデータセット(訓練)

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このチャレンジの主な目標は、2017年のフライシュナー学会に基づいた胸部CTスキャンの自動分類です......

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    README.md

    このチャレンジの主な目標は、2017年のフライシュナー学会の肺結節ガイドラインに基づいて、患者のフォローアップ推奨のために胸部CTスキャンを自動分類することです。

    LNDbデータセットには、2016年から2018年の間にポルトガルのポルトにあるセントロ・オスピタラル・エ・ユニバーシタリオ・デ・サン・ジョアン(CHUSJ)で後ろ向きに収集された294件のCTスキャンが含まれています。すべてのデータは、CHUSJ倫理委員会の承認を得て収集され、患者の生年と性別を除く個人情報を削除するために、分析の前に匿名化されました。患者の選択とデータ収集の詳細については、データベースの説明論文を参照してください。

    各CTスキャンは、CHUSJの少なくとも1人の放射線科医によって読影され、肺結節やその他の疑わしい病変を特定しました。少なくとも4年間、週に最大30件のCTを読影する経験を持つ5人の放射線科医が、プロジェクト全体を通じてアノテーションプロセスに参加しました。アノテーションは、単一盲検方式で行われました。つまり、放射線科医はスキャンを1回読影し、放射線科医間でのコンセンサスやレビューは行われませんでした。各スキャンは、少なくとも1人の放射線科医によって読影されました。手動アノテーションの指示は、LIDC - IDRIから適応されました。各放射線科医は、以下の病変を特定しました:

    • 結節⩾3mm:放射線科医が結節とみなした、最大面内寸法が3mm以上の病変;

    • 結節<3mm:放射線科医が結節とみなした、最大面内寸法が3mm未満の病変;

    • 非結節:放射線科医が結節ではないとみなしたが、結節として識別できる特徴を含む肺の病変;

    アノテーションプロセスは、異なるカテゴリによって異なりました。3mm以上の結節は、LIDC - IDRIに基づいてセグメント化され、主観的に特徴付けられました(微妙さ、内部構造、石灰化、球状度、境界、分葉、棘状突起、質感、悪性の可能性に関する評価)。これらの特徴の完全な説明については、McNitt - Grayらを参照してください。3mm未満の結節については、結節の重心がマークされ、結節の特徴の主観的評価が行われました。非結節については、病変の重心のみがマークされました。異なる放射線科医が同じCTを読影し、コンセンサスレビューが行われなかったため、放射線科医のアノテーションにはばらつきがあることが予想されます。

    なお、LNDbデータセットの294件のCTのうち、少なくとも2人の放射線科医によるアノテーションが付けられた58件のCTと、それに対応するアノテーションは、テストセット用に控えられています。

    利用規約:このデータセット、またはそこから派生したデータは、登録チームに所属していない者には、いかなる場合も提供または再配布することはできません。データセット内のデータがリミックス、変換または拡張された場合、変更後のデータは、いかなる場合も再配布することはできません。

    このデータセットは、いかなる場合も商業目的で使用することはできません。

    このデータが使用されるたびに、目的に関係なく、著者に適切なクレジットを与える必要があります。引用は、データベースの説明論文(https://arxiv.org/abs/1911.08434)または(公開後は)メインのチャレンジの公開文献を通じて行う必要があります。



    引用形式(Bibtex):

    @article{,
    title = {LNDb CTスキャンデータセット(トレーニング用)},
    keywords = {},
    author = {João Pedrosa、Guilherme Aresta、Carlos Ferreira、Márcio Rodrigues、Patrícia Leitão、André Silva Carvalho、João Rebelo、Eduardo Negrão、Isabel Ramos、António Cunha、Aurélio Campilho},
    abstract = {このチャレンジの主な目標は、2017年のフライシュナー学会の肺結節ガイドラインに基づいて、患者のフォローアップ推奨のために胸部CTスキャンを自動分類することです。
    
    LNDbデータセットには、2016年から2018年の間にポルトガルのポルトにあるセントロ・オスピタラル・エ・ユニバーシタリオ・デ・サン・ジョアン(CHUSJ)で後ろ向きに収集された294件のCTスキャンが含まれています。すべてのデータは、CHUSJ倫理委員会の承認を得て収集され、患者の生年と性別を除く個人情報を削除するために、分析の前に匿名化されました。患者の選択とデータ収集の詳細については、データベースの説明論文を参照してください。
    
    各CTスキャンは、CHUSJの少なくとも1人の放射線科医によって読影され、肺結節やその他の疑わしい病変を特定しました。少なくとも4年間、週に最大30件のCTを読影する経験を持つ5人の放射線科医が、プロジェクト全体を通じてアノテーションプロセスに参加しました。アノテーションは、単一盲検方式で行われました。つまり、放射線科医はスキャンを1回読影し、放射線科医間でのコンセンサスやレビューは行われませんでした。各スキャンは、少なくとも1人の放射線科医によって読影されました。手動アノテーションの指示は、LIDC - IDRIから適応されました。各放射線科医は、以下の病変を特定しました:
    
     - 結節⩾3mm:放射線科医が結節とみなした、最大面内寸法が3mm以上の病変;
     - 結節<3mm:放射線科医が結節とみなした、最大面内寸法が3mm未満の病変;
     - 非結節:放射線科医が結節ではないとみなしたが、結節として識別できる特徴を含む肺の病変;
    
    アノテーションプロセスは、異なるカテゴリによって異なりました。3mm以上の結節は、LIDC - IDRIに基づいてセグメント化され、主観的に特徴付けられました(微妙さ、内部構造、石灰化、球状度、境界、分葉、棘状突起、質感、悪性の可能性に関する評価)。これらの特徴の完全な説明については、McNitt - Grayらを参照してください。3mm未満の結節については、結節の重心がマークされ、結節の特徴の主観的評価が行われました。非結節については、病変の重心のみがマークされました。異なる放射線科医が同じCTを読影し、コンセンサスレビューが行われなかったため、放射線科医のアノテーションにはばらつきがあることが予想されます。
    
    なお、LNDbデータセットの294件のCTのうち、少なくとも2人の放射線科医によるアノテーションが付けられた58件のCTと、それに対応するアノテーションは、テストセット用に控えられています。
    
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    terms = {このデータセット、またはそこから派生したデータは、登録チームに所属していない者には、いかなる場合も提供または再配布することはできません。データセット内のデータがリミックス、変換または拡張された場合、変更後のデータは、いかなる場合も再配布することはできません。
    
    このデータセットは、いかなる場合も商業目的で使用することはできません。
    
    このデータが使用されるたびに、目的に関係なく、著者に適切なクレジットを与える必要があります。引用は、データベースの説明論文(https://arxiv.org/abs/1911.08434)または(公開後は)メインのチャレンジの公開文献を通じて行う必要があります。},
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    url = {https://lndb.grand - challenge.org/Data/}
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