文脈 マラリアは、マラリア原虫によって引き起こされる疾患であり、依然として世界の健康に対する大きな脅威であり、毎年2億人に影響を及ぼし、40万人の死亡を引き起こしています。人間に影響を与える主なマラリア原虫の種は、熱帯熱マラリア原虫（Plasmodium falciparum）と三日熱マラリア原虫（Plasmodium vivax）です。 マラリアや他の微生物感染症において、訓練を受けた顕微鏡検査技師による濃厚血塗抹標本と薄層血塗抹標本の目視検査は、試薬や機器のコストが低く、柔軟性が高いため、原虫の検出と段階判定のゴールドスタンダードとなっています。目視検査は処理能力が極めて低く、人為的なバイアスの影響を受けやすいものの、明視野顕微鏡画像のバリエーションが広いため、自動カウントソフトウェアはほとんど使われていません。しかし、堅牢な自動カウントと細胞分類のソリューションは、人為的なばらつきがなく、より迅速かつ正確な定量結果が得られるため、多大な利益をもたらすでしょう。研究者や医療関係者は、段階特異的な薬剤標的をよりよく特徴付け、患者の薬剤反応をより正確に定量することができます。 これまでのマラリアの識別と定量のプロセスを自動化しようとする試みは、再現、比較、拡張が困難であるため、大きな成果を収めていません。著者らは画像セットを公開することがめったになく、これにより結果の再現や潜在的な改善の評価が妨げられています。画像の標準セットも結果を報告するために使用される標準的な指標セットもないため、この分野の進展が妨げられています。 内容 画像は.pngまたは.jpg形式です。異なる研究者がそれぞれ作成した3つの画像セットがあり、合計1364枚の画像（約80,000個の細胞）が含まれています。これらは、ブラジル（Stefanie Lopes）、東南アジア（Benoit Malleret）、および経時的なもの（Gabriel Rangel）です。血塗抹標本はギムザ試薬で染色されています。 # ラベル データは、非感染細胞の2つのクラス（赤血球と白血球）と感染細胞の4つのクラス（配偶子母細胞、リング型、栄養型、裂殖体）で構成されています。アノテーターは、細胞が明確にいずれかの細胞クラスに属さない場合は、一部の細胞を「難しい」とマークすることが許可されています。データは、非感染赤血球が非感染白血球や感染細胞に比べて著しく多く、すべての細胞の95％以上を占めています。 各細胞にはクラスラベルとバウンディングボックスの座標セットが付与されています。すべてのデータセットにおいて、感染細胞のクラスラベルは、ドクター・ハイトール・ヴィエイラ・ドゥラド熱帯医学財団病院のマラリア研究者であるStefanie Lopesによって付与され、発育段階を示すか、「難しい」とマークされています。 謝辞 元のデータは、Broad Institute Repository（https://data.broadinstitute.org/bbbc/BBBC041/）から入手できます。 これらの画像は、マサチューセッツ州ケンブリッジのMITとBroad InstituteのJane Hungによって提供されました。 マラリア原虫の画像データセット（血塗抹標本）をリストしたGithubリポジトリもあります：https://github.com/tobsecret/Awesome_Malaria_Parasite_Imaging_Datasets この画像セットを使用した公開結果 これらのデータセットは、投稿予定の論文で評価されます。 推奨引用 「私たちは、Broad Bioimage Benchmark Collection [Ljosa et al., Nature Methods, 2012]から入手可能な画像セットBBBC041v1を使用しました。」 著作権 画像と正解データは、Jane HungによってCreative Commons Attribution - NonCommercial - ShareAlike 3.0 Unported Licenseの下でライセンスされています。