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OCT画像の分割(AMD)データセット、光干渉断層撮影法(OCT)と加齢黄斑変性(AMD)

OCT画像の分割(AMD)データセット、光干渉断層撮影法(OCT)と加齢黄斑変性(AMD)

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Image Data,Health Conditions,Medicine,Eyes and Vision Classification

加齢性黄斑変性を伴う光干渉断層撮影画像のセグメンテーション用画像。個々のSDOCT画像......

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    README.md

    加齢黄斑変性を伴う光干渉断層撮影画像のセグメンテーション用画像。

    個々のSD-OCT画像とマーキング:269人のAMD患者と115人の正常被験者からの38400枚のBスキャン、彼らの年齢、および中心窩を中心とした直径5mmの範囲の対応するセグメンテーション境界。

    内容

    個々のSD-OCT画像とマーキング:269人のAMD患者と115人の正常被験者からの38400枚のBスキャン、彼らの年齢、および中心窩を中心とした直径5mmの範囲の対応するセグメンテーション境界。

    注:これらの結果はBioptigenシステムでの測定に基づいています。 我々の予備的な結果は、メーカー間、さらにはメーカー内で測定された厚さに差があることを示しています(例えば、中心窩での我々が報告した厚さをSpectralis [Heidelberg Inc, Heidelberg, Germany]の厚さに変換するために1.16の補正係数が使用されます)。

    本研究では、ClinicalTrials.gov(識別子:
    NCT00734487)に登録され、4つのA2A SD-OCTクリニック(Devers Eye Institute、Duke Eye
    Center、Emory Eye Center、およびNational Eye Institute)の施設審査委員会によって承認されたA2A SD-OCT研究からのデータセットを使用しました。ヘルシンキ宣言の原則に準拠して、すべての被験者からインフォームド・コンセントを得ました。

    AREDS2およびA2A SD-OCT研究のデザインと、眼底写真(AREDS2)およびSD-OCT画像(A2A SD-OCT)のグレーディングプロトコルについては報告されています。20,21 簡単に言うと、以下の登録基準を満たす被験者が登録されました:50歳から85歳の間で、両眼に大きなドルーゼン(>125mm)を伴う中等度AMD、または片眼に大きなドルーゼンがあり、他眼に進行性AMDがあり、硝子体網膜手術の既往や視力に影響を与える可能性のある眼科疾患の既往がない者。年齢に適した対照被験者は、AREDS2と同じ登録基準で登録されましたが、ベースライン訪問時および追跡調査年間にどちらの眼にも黄斑ドルーゼンまたはAMDの所見がないことが必要でした。立体カラー眼底写真のペアは、AREDS2プロトコル20の一部としてベースライン訪問時に撮影され、ウィスコンシン眼底写真読影センター(ウィスコンシン大学、マディソン、WI)の認定読影者によってグレーディングされました。本研究では、ウィスコンシンセンターで「グレーディング不可」(考慮対象の視野でドルーゼン領域が部分的にしか見えない、例えば遮蔽病変や写真の質が悪く、ドルーゼンの妥当な評価ができない場合)と判定された眼は除外されました。

    4つのクリニックサイトに設置されたBioptigen, Inc(Research Triangle Park, NC)のSD-OCT撮像システムを使用して、以前に報告されたように体積矩形(w6.7_x0001_w6.7mm)スキャンを取得しました。21 要約すると、すべての被験者について、中心窩を中心とした0度と90度の矩形ボリューム(それぞれ高速走査方向が水平と垂直に向けられて取得されたボリュームと定義されます)が、各Bスキャンに1000本のAスキャン、各ボリュームに100枚のBスキャンで両眼について取得されました。A2A
    SD-OCT研究では、345人のAMD患者のうち314人が少なくとも1眼に中等度AMDを有し、122人の対照被験者のうち119人がベースライン時に眼疾患を有していませんでした。21 これらから、各被験者の1眼が、Leuschenらによって詳細に説明されたようにランダムに研究眼として選択されました。21 眼軸長は測定されませんでした。認定SD-OCT読影者が各ボリュームのスキャン品質を評価しました。21 本研究では、デフォルトで0度のボリュームを選択し、(評価者によって)品質が悪いと判断された0度のボリュームは、同じ訪問時の90度のボリュームで置き換えました。両方のスキャンボリュームが品質が悪い場合は、その眼は完全に除外されました。除外された眼は主に、瞬きや撮像エラーによる空白または極めて低品質の画像を含むもの、または画像取得中に著しい眼球運動や注視喪失を示すボリュームでした。したがって、本研究では、314眼の中等度AMD眼のうち269眼と、119眼の対照(正常)眼のうち115眼を分析しました。

    謝辞

    http://people.duke.edu/~sf59/Farsiu_Ophthalmology_2013.pdf
    http://people.duke.edu/~sf59/RPEDC_Ophth_2013_dataset.htm

    S. Farsiu、SJ. Chiu、R.V. O’Connell、F.A. Folgar、E. Yuan、J.A. Izatt、およびC.A. Toth
    「光干渉断層撮影を用いた中等度加齢黄斑変性の有無による眼の定量的分類」、
    Ophthalmology、121(1)、 162 - 172 2014年1月。

    この方法またはデータセットの一部を使用する場合は、この論文を引用してください。
    このデータセットに関する質問がある場合は、Sina Farsiu博士またはCynthia A. Toth医学博士にご連絡ください。

    バナー画像:UnsplashのHarry Quan


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